先天性心臟病治療方法有兩種：手術治療與介入治療。

　　手術治療為主要治療方式，實用于各種簡單先天性心臟病(如：室間隔缺損、房間隔缺損、動脈導管未閉等)及復雜先天性心臟病(如：合并肺動脈高壓的先心病、法樂氏四聯征以及其他有紫紺現象的心臟病)。

　　介入治療為近幾年發展起來的一種新型治療方法，主要適用于動脈導管未閉、房間隔缺損及部分室間隔缺損不合并其他需手術矯正的畸形患兒可考慮行介入治療。

　　兩者的區別主要在于，手術治療適用范圍較廣，能根治各種簡單、復雜先天性心臟病，但有一定的創傷，術后恢復時間較長，少數病人可能出現心律失常、胸腔、心腔積液等并發癥，還會留下手術疤痕影響美觀。而介入治療適用范圍較窄，價格較高，但無創傷，術后恢復快，無手術疤痕。