75%新生兒腦膜炎主要由B組鏈球菌(主要是Ⅲ型)，含K1多糖的大腸桿菌和單核細胞增多的利斯特菌引起的。腸球菌、非腸道D組鏈球菌、溶血性鏈球菌、其他革蘭氏陰性腸道桿菌。b組流感嗜血桿菌、腦膜炎奈瑟菌、肺炎鏈球菌引起的新生兒細菌性腦膜炎的報道也有增加。