在考慮九省市心肌炎>心肌炎協作組制訂的心肌炎>心肌炎診斷標準時，應首先除外其他疾患，包括風濕性心肌炎>心肌炎、中毒性心肌炎>心肌炎，結核性心包炎、先天性心臟病、膠元性疾病或代謝性疾病或代謝性疾病的心肌損害（包括維生素B1缺乏癥）原發性心肌病、先天必房室傳導阻滯、高原性必臟病、克山病、川崎病、良性早搏和神經功能紊亂，電解質紊亂及藥物等引起的心電圖改變。現重點描述下列四種疾病的臨床特點，以資鑒別：
　　（一）原發性心內膜彈力纖維增生癥 相似之處為心臟擴大，反復出現心力衰竭，可見心源性休克。但本病多發生在6個月以下的小嬰兒。心內膜彈力纖維大量增生及心肌變性等病變累及整個心臟。心電圖及超聲心動圖檢查均顯示左室肥厚為主。臨床表現為反復發作的左心衰竭癥狀，心臟肥大，心音減弱，無雜音或有輕度收縮期雜音。無病毒感染的病史或癥狀，無病毒性心肌炎>心肌炎的實驗室檢查改變。
　　（二）中毒性心肌炎>心肌炎 有嚴重感染或藥物中毒史。常并發于重癥肺炎、傷寒、敗血癥、白喉、猩紅熱等疾病，常隨原發病感染癥狀好轉 而逐淅恢復。使用吐根堿、銻劑等可引起心肌炎>心肌炎，隨藥物的減量或停用而逐漸好轉或恢復。
　　（三）風濕性心臟炎 有反復呼吸道感染史。風濕活動的癥候如高熱，多發性游走性大關節炎，環形紅斑及皮下小結等。有瓣膜病變時出現二尖瓣區收縮期和/或舒張期雜音。實驗室檢查可見血沉增快，C-反應蛋白陽性，粘蛋白增高及抗溶血性鏈球菌“O”，鏈球菌激酶效價增高與咽拭子培養陽性等鏈球菌感染的證據。
　　（四）克山病 相似點為心臟擴大、心律紊亂、出現心力衰竭或心源性休克。但克山病有地方性，發病常在某一流行地區，有多發季節（如東北冬春季，西南夏季為多）及年齡物點（如東北青年婦女，西南2-5歲患兒）。心電圖上以ST-T改變，右束支傳導阻 滯、低電壓者為多見；心律失常心律多變、快變，心率明顯增快或減慢為特點。X線檢查心臟擴大較顯著，搏動顯著減弱，控制心力衰竭后不能回縮至正常。急性期過后多數變為慢性。有時可因心臟中附壁血栓脫落而引起腦栓塞，發生抽搐或偏癱。