㈠. 上呼吸道感染期: 腦膜炎雙球菌在鼻咽部繁殖, 大多數人無癥狀. 少數人覺咽喉疼痛, 流涕等. 大多數患者此期間能自愈, 但此時傳染性很強.

　　㈡. 敗血癥期: 病菌侵入了機體, 當侵入血循環發生全身感染時稱敗血癥. 此期間患者高熱, 頭痛, 惡心, 嘔吐. 70%的患者皮膚粘膜有瘀點或瘀斑.大小約 1cm. 此時患者或親屬所見到的是患者皮膚有 "發青", "發紫" 的瘀點.

　　㈢. 腦膜炎期: 病菌隨血流到腦脊髓膜引起炎癥反應. 腦膜充血水腫, 頭痛劇烈, 嘔吐頻繁, 頸項強直. 進一步嚴重就會神志不清, 抽搐.