溫熱疫癘之邪首先侵入人體，多從口鼻而入，致衛氣郁阻，皮毛開合不利，肺失宣降，出現發熱、惡寒、咳嗽等肺衛證象，邪犯太陽經脈，則出現頸項強直。但本病衛分癥狀極短且不顯，迅速傳入氣分，臨床多見衛氣同病。如發病即見高熱、煩渴、有汗不解，多屬于伏寒化熱的伏氣溫病。衛氣分邪熱不解，熱邪化火，入于營分、血分，出現氣營同病，營血同病。氣營有熱，心神被擾則壯熱，神昏譫語，咽燥口渴。熱邪也可化火犯胃，火性上炎，則頭疼、嘔吐頻繁，甚至呈噴射性嘔吐。邪入營血，熱毒熾盛，里氣壅閉，胃津傷的口渴、唇燥、頸強。病的末期往往消灼肝腎之陰，出現抽搐、瘛疭、驚厥甚至角弓反張。

　　暴發型流腦多起病急驟，熱毒直迫營血，迅速出現“逆傳心包”，出現神昏譫語，驚厥抽搐，或全身瘀斑迅速擴大及出血等。因邪熱疫毒熾盛，病情進展急劇，邪毒蒙閉清竅，陽氣不達四末，出現壯熱、劇烈頭痛，頻繁抽搐，四肢厥冷，胸腹灼熱，面赤氣粗，牙關緊閉等熱甚厥深的竅閉證。或正氣不足，邪毒內陷致陽氣暴脫，出現面色青灰，大汗出，血壓下降，呼吸衰微，肢冷脈厥，甚至氣不攝血，全身瘀斑迅速增多或出血、衄血。